買家付款完成後，若買家有疑慮想退款，買家可向商家「申請退款」。商家需在買家申請後7 天內回覆同意或拒絕，若超過回覆期限，將視為默許同意退款。
同意後，該筆交易顯示退款成功，系統將會開始辦理退款。
若商家不同意退款，並駁回退款申請後，買賣雙方便進行申訴仲裁流程。【OnePaid萬付通】協助雙方調解或依循申訴管道處理，待雙方協商完成，將依照協商之結果撥付款項。

商家採用信用卡、實體/網路 ATM、超商條碼及超商代碼收款時，將依據不同的收款方式有固定的金流手續費。

商家想要提領帳戶內的餘額至自己的金融機構帳戶時，每次提領時將有15元手續費。

每筆手續費皆會開立發票，【OnePaid萬付通】將每日依照您的發票設定開立手續費發票，開立完成後您可至發票查詢查看明細。若設定三聯式發票會員，本公司將於當月月底彙總所有向該會員所收取之服務費（包括但不限於手續費等）帳目後開立一張三聯式發票。
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